İçerik
- Genotip ve Fenotip Nedir?
- HIV Genotiplemesini Açıklamak
- HIV Phenoytyping'i Açıklama
- Genetik Direnç Testi Ne Zaman Yapılır?
Tedavi başarısızlığı meydana geldiğinde, bu yeni dirençli virüs popülasyonunu baskılamak için alternatif ilaç kombinasyonları seçilmelidir. Genetik direnç testi Bu virüslerin olası antiretroviral ajanlara ne kadar duyarlı olduğunu tespit ederken, bir kişinin "viral havuzundaki" dirençli mutasyon türlerini tanımlayarak bunu kolaylaştırmaya yardımcı olur.
HIV'de genetik direnç testi için iki temel araç kullanılır: HIV genotipik tahlil ve HIV fenotipik analizi.
Genotip ve Fenotip Nedir?
Tanımı gereği, bir genotip basitçe bir organizmanın genetik yapısıdır, fenotip ise o organizmanın gözlemlenebilir karakteristikleri veya özellikleridir.
Genotipik tahliller (veya genotipleme), bir hücrenin genetik kodlaması veya DNA içindeki kalıtsal talimatları tanımlayarak çalışır. Fenotipik testler (veya fenotipleme), farklı çevresel koşulların etkisi altında bu talimatların ifadesini doğrular.
Genotip ve fenotip arasındaki ilişki mutlak olmasa da, genotipleme, özellikle genetik koddaki değişiklikler, özelliklerde veya özelliklerde beklenen değişiklikleri sağladığında - ilaç direnci geliştirme durumunda olduğu gibi, fenotip için genellikle tahmin edici olabilir.
Öte yandan fenotipleme, "burada ve şimdi" yi doğrular. HIV'in farklı ilaçlara ve / veya ilaç konsantrasyonlarına maruz kalması gibi, bir organizmanın çevresel basınçtaki belirli değişikliklere tepkisini değerlendirmeyi amaçlamaktadır.
HIV Genotiplemesini Açıklamak
HIV genotiplemesi, genellikle direnç testi için kullanılan en yaygın teknolojidir. Testin amacı, belirli genetik mutasyonları tespit etmektir. gag-pol virüs bölgesi ' genetik şifre (veya genetik kod). Çoğu antiretroviral ilacın hedefi olan ters transkriptaz, proteaz ve integraz enzimlerinin DNA zinciri üzerinde kodlandığı bölgedir.
İlk olarak, polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) teknolojisini kullanarak HIV genomunu amplifiye ederek, laboratuar teknisyenleri çeşitli mutasyon tespit teknolojileri kullanarak virüsün genetiğini sıralayabilir (veya "haritalayabilir").
Bu mutasyonlar (veya mutasyonların birikmesi), tanımlanan mutasyonlar ile virüsün farklı antiretroviral ilaçlara karşı beklenen duyarlılığı arasındaki ilişkiyi analiz eden teknisyenler tarafından yorumlanır. Çevrimiçi veritabanları, test sekansını bir prototip "vahşi tip" virüsünkiyle (yani, dirençli mutasyonlar içermeyen HIV) karşılaştırarak yardımcı olabilir.
Bu testlerin yorumlanması, ilaç duyarlılığını belirlemek için kullanılır ve daha fazla sayıda anahtar mutasyon daha yüksek ilaç direnci seviyelerine yol açar.
HIV Phenoytyping'i Açıklama
HIV fenotiplemesi, bir ilacın varlığında kişinin HIV'inin büyümesini değerlendirir ve ardından bunu aynı ilaçta kontrol, vahşi tip bir virüsün büyümesiyle karşılaştırır.
Genotipik analizlerde olduğu gibi, fenotipik testler HIV genomunun gag-pol bölgesini güçlendirir. Genetik kodun bu bölümü daha sonra bir vahşi tip klona "aşılanır". rekombinant DNA teknolojisi. Elde edilen rekombinant virüs, memeli hücrelerini in vitro (laboratuvarda) enfekte etmek için kullanılır.
Viral numune daha sonra,% 50 ve% 90 viral baskılama elde edilene kadar farklı antiretroviral ilaçların artan konsantrasyonlarına maruz bırakılır. Konsantrasyonlar daha sonra kontrol, yabani tip numuneden elde edilen sonuçlarla karşılaştırılır.
Göreceli "kat" değişiklikler, ilaca duyarlılığın belirlendiği değer aralığını sağlar. Dört katlık bir değişiklik, basitçe, vahşi tipe kıyasla viral baskılamayı sağlamak için ilaç miktarının dört katına ihtiyaç duyulduğu anlamına gelir. Kat değeri ne kadar büyükse, virüs belirli bir ilaca karşı o kadar az duyarlıdır.
Bu değerler daha sonra alt klinik ve üst klinik aralıklar içine yerleştirilir ve üst değerler daha yüksek ilaç direnci seviyelerine yol açar.
Genetik Direnç Testi Ne Zaman Yapılır?
ABD'de, genetik direnç testi, geleneksel olarak, herhangi bir "kazanılmış" ilaç direncine sahip olup olmadıklarını belirlemek için daha önce tedavi görmemiş hastalar üzerinde gerçekleştirilir. ABD'deki araştırmalar, bulaşan virüsün% 6 ila% 16'sının en az bir antiretroviral ilaca dirençli olacağını, yaklaşık% 5'inin birden fazla ilaç sınıfına dirençli olacağını göstermektedir.
Genetik direnç testi, tedavideki bireylerde ilaç direncinden şüphelenildiğinde de kullanılır. Test, hasta başarısız rejimi alırken veya viral yük 500 kopya / mL'den fazlaysa tedavinin kesilmesinden sonraki dört hafta içinde gerçekleştirilir. Genotipik test, daha az maliyetli oldukları, daha hızlı bir geri dönüş süresine sahip oldukları ve vahşi tip ve dirençli virüs karışımlarını tespit etmek için daha fazla hassasiyet sundukları için genellikle bu durumlarda tercih edilir.
Karmaşık, çoklu ilaç direnci olan kişiler için, özellikle proteaz inhibitörlerine maruz kalanlar için fenotipik ve genotipik testin bir kombinasyonu genellikle tercih edilir.